1550 – Le prime notizie dell’edificio risalgono al 1550, quando, dopo una visita pastorale, viene riportato che la chiesa contava sotto la sua cura circa 40 anime. Nella visita successiva, avvenuta nel 1569, la chiesa risulta consacrata, manca il battistero e il confessionale. Tuttavia, sono già presenti la torre campanaria e la cappella interna dedicata a S. Giustina. Dalla chiesa si accedeva al cimitero adiacente e, da lì, alla casa del parroco, già presente anche se non vi era un cappellano dedicato e le funzioni erano celebrate dal parroco di Lecco.
1608 – Nel 1608, dopo la visita del monsignor Albergato, si deduce che l’edificio fu dotato di un Fonte battesimale, sebbene non fosse stata costruita alcuna cappella dedicata. Inoltre, per la prima volta, il nome di S. Cipriano venne affiancato a quello di S. Giustina. La chiesa di Germanedo fu eretta parrocchia il primo febbraio 1648. Fino al XIX secolo l’edificio rimase pressoché invariato. Successivamente, nel 1823, fu realizzato il coro e l’altare di marmo, su progetto dell’Ingegner Bovara.
1836 – Nel 1836, la chiesa fu completamente restaurata e decorata secondo lo stile neoclassico, su disegno dell’Architetto Felice Pizzagalli. I lavori terminarono nel 1847, dopo la costruzione dell’organo.
1900 – All’inizio del 1900, nacque l’idea di realizzare una nuova chiesa. Tuttavia, ciò rimase solo un progetto, in quanto si ripiegò, durante il primo dopoguerra a causa delle ristrettezze economiche, sulla sola costruzione di un nuovo campanile per la chiesa dei Santi Cipriano e Giustina.
Il progetto per una nuova chiesa venne ripreso intorno agli anni ’60 e, il 26 giugno 1966, venne posata la prima pietra della nuova struttura, addossata all’esistente. Il 21 maggio 1967, la nuova chiesa fu inaugurata e benedetta.
Il progetto venne redatto dall’arch. Bruno Bianchi di Lecco.

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